令孤冲（李连杰）在一次与师兄弟下山办事的过程中，意外的发现东方不败（林青霞）与倭寇串通有谋反之意，便与任盈盈（关之琳）向问天及蓝凤凰（袁洁莹）等计划，准备救出任我行联手除掉东方不败，夺回日月神教。但令孤冲不认识东方不败，误把东方不败当成一位美貌少女，以至于使自已的同门尽皆死于东方不败之手。于是令孤冲、任盈盈、向问天、任我行等一同去找东方不败报仇。在一场激烈的打斗中令孤冲面部被划伤，任我行一只眼被刺瞎，向问天小腿受伤，而东方不败坠入山崖… 华山大弟子令狐冲与师妹往野店与任盈盈会面，才得知盈及其父--日月教教主任我行同告失踪，而右使东方不败则暂代教主。原来野心勃勃的东方不败获武林秘笈葵花宝典，不惜自宫苦练，希望一统江湖，但外貌上却越发像个女人模样。一日令与东相遇，旋即一见钟情，东碍于自己是男儿身，遂命爱妾在黑暗中与令缠绵，而伺机夜袭野店，把一众华山弟子杀掉，令得知真相后，决心上黑木崖与东决一生死…
