讲述是根据2013年上映的剧场版动画《攻壳机动队ARISE》改编而成的TV版动画，并且会在原版的基础上增加两话的新剧情。攻壳机动队ARISE TV版动画全集舞台是「公安9课」还不是最重要的先遣冲锋部队A.D.2027。在十分懂得权术、老谋深算的公安捜査的荒卷面前出现是女性隶属于陆军「501机关」的草薙素子三佐。拥有最高度的物理与电脑作战技能的她，和荒卷比起来显得不谙世事。不过这样的她也和荒卷共同行动，解决了很多犯罪事件。但者同样引起了「501机关」的注意，尤其是作为上司以及保护者的女野心家久留津中佐产生了摩擦。与此同时，谜样的病毒「Fire Starter」出现了，在各种疑难事件群起之中，「拥有不眠之眼的前特部队队员」、「已经成家的特捜刑事」等各种个性的人才汇聚到了草薙素子身边。和荒卷有着共同目的的草薙素子投身到了建立「针对犯罪特设的精锐部队」的计划中「攻壳机动队ARISE」这是草薙素子被称为「少佐」之前的物语。
